La Fundación para el Estudio del Derecho Histórico y Autonómico de Vasconia tiene como antecedente la labor desarrollada Instituto de Derecho Histórico de Vasconia, creado por la Universidad del País Vasco-Euskal Herriko Unibertsitatea en julio de 2000. En septiembre de 2003, el Consejo Rector del Instituto adoptó el Acuerdo de proceder a la disolución del mismo. Al evaluar las actividades académicas desarrolladas, se llegó a la conclusión de que la finalidad científica perseguida podría conseguirse con mayor eficacia de gestión adoptando una forma institucional más flexible, aunque no menos garantista en cuanto al control de funcionamiento y, por tanto, sometida a la tutela de la Administración en función de su ámbito. Por ello, en enero de 2004 se procedió a constituir la Fundación para el Estudio del Derecho Histórico y Autonómico de Vasconia (FEDHAV), con sede en Donostia/San Sebastián.

El Instituto de Derecho Histórico de Vasconia organizó dos simposios y publicó dos números de la revista Notitia Vasconiae. Tras la constitución de la Fundación la nueva institución tomó el relevo tanto en la organización de los simposios como en la edición de la revista que pasó a llamarse Iura Vasconiae. Revista de Derecho Histórico y Autonómico de Vasconia.